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乐鱼测序仪巨头推出AI算法,预测致病基因突变—新闻—科学网

发布日期:2024-04-21 14:00:10 访问量:53 来源:乐鱼智能

ChatGPT等年夜模子点燃人工智能新一轮热潮之际,另外一种累积数百万年的天书般“言语”也于试图用该技能得到最新解码。近日,全世界基因测序仪龙头因美纳(Illumina)公布推出全新的人工智能算法PrimateAI-3D,以求更正确地猜测患者致病基因突变。

据美国国度卫生研究院发布的数据,每一年天生的基因组数据量靠近400亿GB。然而,获取这些数据仅仅是解开诸多生命谜团的第一步,想要让它们真正有助在人类康健,尚需深度的解读以及阐发。

今朝的科学研究显示,每一个人都携带着数百万种基因变异,恰是这些变异致使了康健以及疾病危害的个别差异,但今朝年夜大都变异的作用体式格局尚不明确。美国贝勒医学院人类基因组测序中央以及因美纳人工智能试验室但愿借助PrimateAI-3D更进一步解决问题。

据因美纳方面先容,PrimateAI-3D接纳了与ChatGPT以及AlphaFold近似的深度神经收集架构,差别的地方于在PrimateAI-3D是按照基因组序列而不是人类言语来举行练习。“你可以于维基百科以及其他处所的现有文本上练习ChatGPT等天生言语模子,咱们使用了近似的深度进修架构,但咱们的数据来自数百万年的天然选择。”因美纳人工智能副总裁Kyle Farh暗示。

别的,于ChatGPT等天生言语模子中,现有的文本就能够为练习提供信息,而人类基因组中致使疾病的基因变异于很年夜水平上倒是未知的。为解决这一问题,PrimateAI-3D哄骗天然选择来练习深度神经收集的参数,这类练习基在此前对于233种差别灵长类植物举行测序时发明的数百万种良性基因变异来开展,这也是迄今为止开展的最年夜范围的非人类灵长类物种测序事情。

“咱们已经经证实,咱们对于非人类灵长类植物的遗传变异相识患上越多,就越能更好地猜测哪些突变可能致使人类疾病。”来自美国贝勒医学院的Jeffrey Rogers说。

随后,包孕Rogers于内的美国贝勒医学院人类基因组测序中央及份子与人类遗传学系的研究职员以及Farh带����APP领的因美纳人工智能试验室团队,将PrimateAI-3D算法运用到了英国生物样本库的近50万个个别中,辨认潜于的致病人类突变。与之相干的两篇研究近日揭晓于顶级学术期刊《科学》(Science)上。

他们发明,于查询拜访的90种差别临床病症中,平凡人群里97%的康健成员的基因组中至少暗藏着一种高度可干涉干与变异。研究成果还发明了致使常见病高危害的稀有基因变异。Farh说,整体而言,PrimateAI-3D于评估血汗管疾病以及2型糖尿病等康健问题的遗传危害方面,比以往任何一种要领正确度都要提高至少12%。

Farh还增补提到,这项新技能的一个上风于在,它一样合用在整小我私家类。这也象征着,其降服了现有遗传危害评估中固有的对于欧洲白人血统人群的成见,这些评估重要基在这些群体的数据。

因美纳首席技能官Alex Aravanis暗示,“将最新的人工智能技能运用在基因组学,以展现糖尿病、心脏病以及自身免疫性疾病等繁杂遗传疾病的要害底层信息,这一技能的推出为因美纳于遗传危害猜测以及药物靶点发明方面带来伟大机缘。”

据因美纳方面暗示,PrimateAI-3D将集成于因美纳的互联软件中,供基因组学界使用。

(原标题:测序仪巨头因美纳基在灵长类植物基因推出AI算法,猜测致病基因突变)

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