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乐鱼细胞用量大幅减少,新技术提升单分子DNA测序水平—新闻—科学网

发布日期:2024-06-18 04:32:43 访问量:53 来源:乐鱼智能

美国格拉德斯通研究所团队开发了两种新的单份子阐发东西,可将所需的DNA量削减90%至95%。该研究结果揭晓于最新一期《天然 遗传学》杂志上,展示了这些东西怎样帮忙科学家解决他们之前没法回覆的生物学问题。

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单份子及时测序示用意。图片来历:《天然 遗传学》

单份子阐发的黄金尺度要领凡是需要至少150000小我私家类细胞,此中包罗数百万个单个DNA份子。这象征着研究职员于只要几千个细胞可历时,底子没法运用这些东西,例如于很多肿瘤活检中。

团队这次开发的新东西被称为“单份子及时标志测序”(简称SMRT-Tag),它可同时绘制长DNA片断中的碱基序列,和DNA长度上称为甲基的化学布局位置。甲基于基因表达中起着要害作用,人们想要相识疾病,就需要相识它们于DNA上的配置体式格局。

团队接纳了全新“标志”要领,即哄骗细菌卵白Tn5将DNA份子切割成更容易在处置惩罚的片断,并用进一步阐发所需的化学身分对于其举行“标志”。研究面对的应战是要让“标志”能恰如其分地将少许DNA分化成约3000到5000个碱基对于的长片断。他们用发夹状布局“标志”每一个片断的结尾,造成便在测序仪读取的长DNA环。

研究证实,SMRT-Tag要领的机能与此前要领同样好,但使用的DNA量要少患上多,相称在于10000个细胞中发明的DNA量。

接下来,团队将SMRT-Tag与他们以前开发的名为SAMOSA要领联合起来。SAMOSA可展现基因表达机制怎���样轻松拜候差别DNA片断。为了证实全新的“SAMOSA-Tag”东西的威力,他们将其运用在前列腺癌细胞(一些来自患者的初始肿瘤,一些来自已经散布到身体差别位置的肿瘤),这些细胞已经被移植并于小鼠体内生长。该要领乐成展现了染色质可及性差异,这表示了癌症转移的可能要害驱动要素。

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