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乐鱼新研究“点亮”荧光RNA成像的结构机制—新闻—科学网

发布日期:2024-08-29 11:46:07 访问量:53 来源:乐鱼智能

5月17日,中国科学院生物物理研究所方显杨研究组与植物研究所李幸研究组互助于《天然-通信》上揭晓研究论文,展现荧光点亮RNA适配体RhoBAST联合与激活荧光团TMR-DN的机制,为理性设计以及优化这一主要的FLAP体系提供了机制见解。

于活细胞中对于生物年夜份子如卵白质以及RNA等举行时空定位以及追踪,对于在理解它们的生物学功效以及展现其机制至关主要。今朝,荧光点亮RNA适配体(FLAP)被以为是强无力的活细胞RNA荧光成像东西。此中,RhoBAST是一种体现优秀的FLAP成像东西,可以联合并激活一种接触淬灭型罗丹明衍生物TMR-DN,并于RNA的超分辩率成像中体现出优秀的机能,但其联合以及激活荧光染料的布局机制还不清晰。

研究职员起首运用X射线晶体学剖析了RhoBAST与TMR-DN复合物的高分辩率布局,发明RhoBAST折叠成一种四分支布局,总体布局近似在不合错误称的“A”字形。研究发明,RhoBAST的布局刚性和半开放的布局口袋的特性可能还付与它与配体倏地互换的动力学机能,其要比其它FLAP如pepper体系至少快两个数目级以上,是以可以经由过程与溶液中鲜嫩配体的倏地互换来很好地防止光漂白问题,使其于荧光超分辩成像揭示出优质的光学性子。

为了更好理解RhoBAST对于TMR-DN的激活机制,研究职员接纳加强采样的份子动力学模仿要领表征了TMR-DN于自由态和与RhoBAST联合状况下的构象空间。成果注解,不管是自由照旧联合状况下,TMR-DN都出现出一种高度动态的构象特性,此中接触-非重叠构象盘踞所有接触类型中的大都。

相干论文信息:

https://doi.org/10.1038/s41467-024-48478-9

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