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乐鱼最大动物基因组图谱——南极磷虾基因组图谱破译—新闻—科学网

发布日期:2024-01-31 20:15:02 访问量:53 来源:乐鱼智能
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Cell官网截图。黄海水产研究所供图

日前,由中国水产科学研究院黄海水产研究所结合青岛华年夜基因研究院、德国阿尔弗雷德 魏格纳研究所、Australia联邦科学与工业研究构造等机构组建的国际研究团队,完成为了迄今为止最年夜植物基因组参考序列 南极磷虾基因组拆卸,并展现了南极磷虾顺应极度情况以及群体汗青演化的份子根蒂根基。北京时间3月3日,国际顶级学术期刊《细胞》(《Cell》)以 伟大高反复基因组图谱绘制展现了南极磷虾情况顺应机制及其群体演化汗青 为题,于线揭晓了该研究结果。

研究团队哄骗新一代测序技能对于南极磷虾开展了高深度的基因组测序、拆卸以及阐发,构建了迄今为止地球上最年夜的植物基因组参考序列,其巨细为48Gb,约为人类基因组的16倍。研究发明南极磷虾基因组中反复序列含量高达92.45%,这源在南极磷虾基因组反复序列的两次发作式扩张,这也是今朝为止已经报导的基因组反复序列含量最高的物种。

于本研究中,研究职员对于南极磷虾应答极昼极夜等极度情况的顺应性举行了研究。经由过程与果蝇以及哺乳植物比力发明,双反馈回路中的要害基因没出缺掉,而部门基因于夏日以及冬日显示出差别的表达程度,注解南极磷虾已经经进化出由日夜节律体系节制的身体顺应以及举动模式。此外,于磷虾基因组中鉴定到25个显著扩张的基因家族中,有12个与南极磷虾蜕壳或者能量代谢相干,这注解南极磷虾的相干基由于其顺应极地非凡情况奠基了遗传根蒂根基。

为了探究南极磷虾的群体特性,研究团队于南冰洋4个南极磷虾生物量较高的区域收罗了75只,举行了群体遗传学研究。成果发明,虽然漫衍于差别的区域,但南极磷虾的遗传序列构成没有较着区分,这就象征着差别地区群体之间没有本色性差异。可是,南极磷虾的遗传分解仍会受����APP其地点情况的影响。

南极磷虾何故造成云云伟大的资源量?南极磷虾资源量造成与储蓄积累又履历了如何的汗青蜕变历程?研究团队经由过程对于南极磷虾群体演化汗青的阐发发明,磷虾的有用种群范围先于1000万年前急剧减小,这与更新世时期冰期-间冰期天气的剧烈颠簸相吻合;于10万年前,南极磷虾种群范围呈现反弹,最先扩张,其缘故原由多是晚更新世时期较冷的温度致使的海冰扩张,扩展了磷虾的栖息地,进而呈现了种群的扩张。

上述研究发明为海洋生物极度情况顺应机制及其群体演化的深切剖析提供了新的理论参考,也为南极磷虾渔业资源的治理提供了理论依据,对于在培育我国南极磷虾这一海洋生物质源开发哄骗新兴战略财产、深度介入极地渔业国际管理具备庞大意思。

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