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乐鱼这篇Nature论文曾被Science拒稿,作者总结经验:捅破窗户纸!—新闻—科学网

发布日期:2024-05-21 12:13:25 访问量:53 来源:乐鱼智能
近日,中国科学院生物物理研究所的3名 95后 玻士生迎来了他们人生中的第一篇《天然》论文。3张年青脸庞绽开的笑脸,与一年前的懊丧造成了光鲜对于比。 图片

3名 95 后配合一作(从左至右:李晶晶、余聪、葛蔚然)受访者供图(下同) 其时这篇论文方才被另外一家顶级学术期刊《科学》拒稿,拒绝的理由很是让人挫败: 立异性不敷 。独一值患上欣慰的是,编纂表达了一个不雅点: 你们研究的这个问题很是有趣。 获得这个评价后,几名作者从头撰写了文稿,细心修改了择要以及主图,把编纂眼中 有趣 的问题讲述患上越发详尽,也让论文中最富新意的部门越发凸显。终极这项事情博得了《天然》杂志的青睐。 这是一个很典型的案例。 本文配合通信作者之1、生物物理所研究员朱冰对于《中国科学报》说, 当你有一个所谓的 卖点 的时辰,必然要把它提炼患上充足清楚,要擅在把那层朦昏黄胧的 窗户纸 捅破。 请勿感觉这只是论文写作的小技巧,这类威力也能帮忙你更好地凝炼科学问题,做出更有价值的事情。 他说。 图片

《天然》论文截图

有趣的问题:它是怎么选择 CP 的?

于论文配合第一作者葛蔚然的讲述中,这项研究逐渐活泼起来: 各人都知道DNA是生物遗传信息的载体,但你知道它们于真核细胞中是怎么存于的吗?

于真核细胞中,DNA像绳索同样环绕纠缠于八个组卵白上,造成近似悠悠球的布局,叫作 核小体 ;核小体经由过程DNA一个一个串起来,然后被有纪律地折叠打包,再装进细胞核里。有趣的是,每一个组卵白都有可以矫捷摆动的尾巴,能伸到核小体外面。尾巴的差别位置可以被打上差别的 记号 ,这些记号不只能影响染色质折叠的状况,还可以作为一种信息,告诉下流的卵白要请勿过来事情,从而调控基因的表达。 即便DNA的序列没有发生变迁,组卵白上的记号也能经由过程影响基因表达,造成可遗传的表型变迁 这类机制就属在 表不雅遗传学 。 于细胞里,既有画下记号的 笔 ,读记号的 眼睛 ,也有能擦失这些记号的橡皮 。 葛蔚然耐烦地注释着, 咱们这篇论文存眷一个很闻名的 记号 组卵白H2A泛素化润色,可以或许擦除了它的 橡皮 叫做PR-DUB复合物。只管这对于 CP 已经经被研究患上很是多了,但人们始终不知道PR-DUB是怎么于核小体上去失泛素化润色的。 这个征象最诱人之处于在,于体内时,PR-DUB只能去除了核小体H2A特定位点的泛素化润色,而不克不及去除了其它位点的泛素化润色。但当PR-DUB脱离核小体后,就再也不具有这类特同性了,它变患上可以擦除了差别位点上的泛素化润色。 这申明于核小体程度上,存于咱们不知道的份子机制来实现这类底物的特同性选择。 葛蔚然说。这恰是编纂口中,最有趣的问题地点。 终极的谜底出人意表:PR-DUB中阐扬重要作用的酶叫做BAP1,这个酶的布局是无方向性的。核小体上探出来的组卵白 尾巴 ,能高高地翘起来,拐一个很年夜的弯达到BAP1的活性中央,从而让这个酶特同性地擦除了尾巴上的H2A泛素化润色。而其他位点上的泛素化润色,因为标的目的不合错误,没法抵达BAP1酶的活性中央,也就不克不及被消弭了。 这是一个很是成心义的发明。 朱冰向《中国科学报》注释, 年夜大都染色质润色酶的特同性,是经由过程局部的特同性 催化口袋 实现的。而这个酶,是已经知独一一个经由过程年夜规模的布局取历来得到特同性的。打个比喻,它靠的不是口袋自己的布局有特同性,而是间接把口袋转了个标的目的,只以及启齿标的目的的底物联合。 假如将来发明,它不是 独一一个 ,而是 第一个 ,那就更有趣了。那将年夜年夜拓展咱们对于酶特同性的熟悉。 朱冰增补道, 我想这才是《天然》接管这项事情的缘故原由。

3位 95后 的接力时速

这篇论文的3位配合一作都是 95后 ,此中两人出生在1995年,一人出生在1997年。3个年青人于这项事情中都履历了很多应战,也收成了伟大的发展。

本年26岁的葛蔚然,看起来比现实春秋还要小一些。8年前,她以691分的高考绩绩成为中国科学院年夜学(国科年夜)第二批本科生。于以 科教交融 为特点的国科年夜,本科生就能够选择一名科学家作为本身的学业导师,就如许,葛蔚然来到了生物物理研究所研究员许瑞明门下。 图片

年夜四这年,许教员给她两个课题来选择。第一个课题比力简朴,第二个课题则是 传说中的难题 此前有一名师姐直到卒业也没能做出来。没有太多夷由,葛蔚然选择了更有应战性的阿谁。 但即即是 学霸 ,刚最先做试验时也几次受挫, 十有八九都是掉败的成果 。于不停反复以及试错的历程中,她徐徐磨炼出越发踊跃和蔼的心态,对于常识以及技能的掌握也愈来愈熟练了。 28岁的余聪是葛蔚然的同门师兄,重要卖力这项事情中有关冷冻电镜的部门。于为PR-DUB与核小体复合物样品 照相 这一步上,他足足困了3年。 由于酶阐扬作用的速率很是快,整个历程转眼即逝,很难用冷冻电镜拍清晰。 就像拍一个迅速摇头的人。他的身体以及四肢都很清晰,惟独最主要的脑壳看不清晰。 他笑道。 厥后,他们想出一套巧妙的措施:引入单点突变来降低酶的活性,让酶的动态酿成 慢动作 。同时应用卵白质交联等技能,不松不紧方才好地把酶的 脑壳 固定住。终究拍出了清楚的照片。 这个难点冲破后,后续的研究事情就顺遂了许多。 图片 余聪以及导师许瑞明合影 此时,本文的第三位配合一作,朱冰课题组的李晶晶插手了这项事情。她重要卖力于细胞内验证上述布局以及功效的精妙瓜葛。这部门事情于技能上不是出格坚苦,但她需要与时间竞走。 出格是第二次审稿后增补试验的时辰,《天然》编纂只给了他们一个月时间。但细胞试验的固有周期是没法缩短的,一个月的时间必定不敷用。于许瑞明以及朱冰两位教员的争夺下,他们又获得了两周的宽限时间。但编纂同时也告诉他们,假如这两周内有其他团队的近似事情揭晓了,就会把这篇论文拒稿。 其时刚巧是2022年末北京疫情很是严重的期间,为了不出师未捷人先 阳 ,李晶晶把行李带到试验室,像游击队员般完成为了后续所有试验。 图片 李晶晶以及导师朱冰合影 于所有人的起劲下,这篇论文终究乐成被《天然》杂志吸收。而论文吸收几天后,预印本消息网上就呈现了一项纽约年夜学医学院科学家揭晓的近似事情。 他们跑赢了。

捅破窗户纸,才气做更好的科研

约莫五、6年前,近似如许剖析核小体以及染色质润色酶布局的论文大都都能揭晓于顶级学术期刊上。但此刻,这可一点也不易了。

缘故原由很简朴,布局生物学的技能始终于成长,剖析这些布局变患上愈来愈简朴。 朱冰说, 这迫使布局生物学家们从头审阅,甚么才是更主要的科学问题,甚么才是更好的科学研究。 第一次投稿到《科学》杂志上的稿件,对于文中真正主要以及闪光的部门,只是迷迷糊糊地提到,但没有把窗户纸捅破。而颠末修改后的稿件,把他们发明的新颖征象,晋升到了一个充足的理论高度。 这毫不仅仅是写作技巧以及 倾销 技巧。 朱冰晚年曾经于中国科学院上海动物心理研究所攻读玻士学位,其时中国科学院院士沈善炯的一个特色给他留下了深刻印象: 沈师长教师很是擅在总结,擅在把征象晋升到理论程度。一样的一件事,让他来说,就能讲到人们心里。 这类思惟上、熟悉上的高度,不只能让科学家更好地总结本身做过的事情,也有助在晋升科学家的咀嚼,让他们前瞻性地选择更有价值、更有高度的事情。 朱冰说。 论文链接: https://www.nature.com/articles/s41586-023-05841-y出格声明:本文转载仅仅是出����APP在流传信息的需要,其实不象征着代表本消息网不雅点或者证明其内容的真实性;如其他媒体、消息网或者小我私家从本消息网转载使用,须保留本消息网注明的“来历”,并自大版权等法令义务;作者假如不但愿被转载或者者接洽转载稿费等事宜,请与咱们联系。/乐鱼

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